[р.Б.Константин]

Предположим, что селекционер будущего вывел породу собак, не карикатурно-уродливую, а вполне функциональную, типа сенбернара.
Почему селекционер будущего - а потому, современные сенбернар относительно свободно скрещивается с другими собаками, в результате через пару-тройку поколений получаем дворняжку увеличенного размера и висячими ушами - всё, что осталось от сенбернара.
А вот селекционер будущего еще и добавит в этологические паттерны избирательность, так, что будет прекопуляционная изоляция.

Вопрос: можно ли доказать/показать, что полученный (под)вид - искусственный?
Например, можно будет показать, что популяция Canis senbernaris обладает низким/нулевым полиморфизмом - но кого этим сейчас убедишь?
С трудом, но можно будет показать, что это вообще чистая линия (оба набора хромосом - практически идентичны друг другу).

Думаю, что "Т"Э эта "загадка природы" вполне по зубам, объяснительного потенциала хватит.

Через отсутствие корреляции изменений фенотипа с "естественными" факторами среды?

Это трудно - но мы же в будущем. Big Data, везде датчики.

Вопрос: можно ли доказать/показать, что полученный (под)вид - искусственный?
Например, можно будет показать, что популяция Canis senbernaris обладает низким/нулевым полиморфизмом - но кого этим сейчас убедишь?
С трудом, но можно будет показать, что это вообще чистая линия (оба набора хромосом - практически идентичны друг другу).

Думаю, что "Т"Э эта "загадка природы" вполне по зубам, объяснительного потенциала хватит.

Конечно же, у ТЭ хватит объяснительного потенциала, если мы наблюдаем вид с низким генетическим и фенотипическим полиморфизмом, обитающий в определённом ареале, занимающий свою экологическую нишу и, возможно, прошедший через бутылочное горлышко.

Вот если бы мы наблюдали скопом множество видовых рас без явных экологических ниш для каждой расы, без раздельного существования каждой расы в своём ареале и без зон гибридизации, рас, не имеющих репродуктивной изоляции, но с большими отличиями морфологии на уровне разных родов и с умеренным генетическим полиморфизмом, то это для ТЭ было бы сложно объяснить.

[Снеговой Павел]

Вот если бы мы наблюдали скопом множество видовых рас ... то это для ТЭ было бы сложно объяснить.

Объяснить можно все. Вспоминаются рыбки из озер Малави и Виктория.