Абиогенез пиримидиновых нуклеотидов (Sutherland, 2009)

Абиогенез пиримидиновых нуклеотидов (Sutherland, 2009)

Сообщение р.Б.Константин » 15 май 2009, 13:56

Synthesis of activated pyrimidine ribonucleotides in
prebiotically plausible conditions
(Синтез активированных пиримидиновых рибонуклеотидов в пребиотически обоснованных условиях)
Matthew W. Powner, Beatrice Gerland & John D. Sutherland
Nature 459, 239-242 (14 May 2009)

Резюме:

"На какой-то стадии происхождения жизни должен был образоваться информационный полимер, чисто химическим способом. По одной из версий гипотезы "мира РНК" этот полимер был РНК, но попытки экспериментального подтверждения этой версии не удались. В частности, хотя были достигнуты некоторые успехи в полимеризации "активированных" рибонуклеотидов в РНК, синтез самих рибонуклеотидов из исходных компонентов (рибозы и азотистых оснований) был далек от ясности. D-Рибозу трудно синтезировать, соединение аз.оснований с рибозой неэффективно в случае пуринов и не происходит вовсе в случае канонических пиримидинов. В данной статье мы показываем, что активированные пиримидиновые рибонуклеотиды могут быть образованы в короткой последовательности (реакций), которая обходит (этапы синтеза свободных) рибозы и аз.оснований, вместо этого двигаясь через промежуточные соединения арабиноза-амино-оксазолин и ангидриды нуклеозидов.
Стартовый комплект материалов - цианамид, цианоацетилен, гликольалдегид, глицеральдегид и фосфат - подходят под роль пребиотических стартовых молекул, а условия синтеза соответствуют моделям ранней Земли.
Хотя неорганический фосфат добавляется к нуклеотидам на поздней стадии синтеза, его присутствие с самого начала существенно, поскольку он управлеят ходом трех предыдущих реакций, действуя как кислотно-основный катализатор, катализатор-нуклеофил, буфер pH buffer и химический буфер"

Мои выводы:
1. Наконец-то признались, что рибоза+азотистое основание не дает нуклеозида. Никак. Признались, потому что нашли способ обойти.
2. Нельзя сказать, что исходные ингредиенты - цианамид, цианоацетилен, гликольалдегид, глицеральдегид и фосфат - это соединения, которые кишмя кишат в океанах или атмосфере. Тем не менее, они используются в концентрациях 1-49 ммоль/л, а фосфат - 1 моль/л.
3. вопрос стереоизомеров не решен, т.е. получается смесь стереоизомеров, рацемат, на след. стадии берется чистый нужный стереоизомер, без ненужного.
4. получается много ненужных нуклеотидов, ненужные убирается ультрафиолетом, поскольку цитозин и урацил - самые УФ-стабильные. При этом, еще недавно мне доказывали. что тот самый нужный УФ не добивает до поверхности Земли, даже в безкислородной атмосфере..
Вложения
pirimidine.gif
pirimidine.gif (17.65 KiB) Просмотров: 7724
Аватар пользователя
р.Б.Константин
Супермодератор
 
Сообщений: 215
Зарегистрирован: 17 апр 2008, 23:26
Кредо: Creatio+Evolutio

Re: Абиотический синтез пиримидиновых нуклеотидов

Сообщение р.Б.Константин » 15 май 2009, 14:12

На определенном этапе этого спонтанного химического синтеза образуется химическое соединение - 2-аминооксазол. Это соединение отличается большой летучестью, а потому ученые полагают, что в условиях "пребиотического супа" - смеси органических и неорганических молекул в воде, из которой в последствии и сформировались биологические молекулы, оно могло быть выделено и очищено от примесей возгонкой.

Днем при солнечном освещении и нагревании это соединение испарялось, а ночью при охлаждении оседало обратно в концентрированной форме, которую можно назвать "органическим снегом". После этого превращение аминооксазола в нуклеотид, содержащий рибозу с присоединенным к ней азотистым основанием требует всего нескольких стадий.


я достал статьи.
Аватар пользователя
р.Б.Константин
Супермодератор
 
Сообщений: 215
Зарегистрирован: 17 апр 2008, 23:26
Кредо: Creatio+Evolutio

Re: Абиотический синтез пиримидиновых нуклеотидов

Сообщение Лужехмур » 15 май 2009, 17:30

А можно на русский перевести? :)
Лужехмур
Форумчанин
 
Сообщений: 65
Зарегистрирован: 31 янв 2009, 17:57

Re: Абиотический синтез пиримидиновых нуклеотидов

Сообщение р.Б.Константин » 15 май 2009, 21:20

Лужехмур писал(а):А можно на русский перевести? :)

--Что именно?
Аватар пользователя
р.Б.Константин
Супермодератор
 
Сообщений: 215
Зарегистрирован: 17 апр 2008, 23:26
Кредо: Creatio+Evolutio

Re: Абиотический синтез пиримидиновых нуклеотидов

Сообщение Лужехмур » 15 май 2009, 21:57

Что это значит и какие выводы?
Лужехмур
Форумчанин
 
Сообщений: 65
Зарегистрирован: 31 янв 2009, 17:57

Re: Абиотический синтез пиримидиновых нуклеотидов

Сообщение Лужехмур » 18 май 2009, 12:55

Вот тут ещё что-то есть: http://elementy.ru/news?newsid=431082
Вопрос к специалистам: какие будут выводы?
Лужехмур
Форумчанин
 
Сообщений: 65
Зарегистрирован: 31 янв 2009, 17:57

Re: Абиотический синтез пиримидиновых нуклеотидов

Сообщение р.Б.Константин » 18 май 2009, 15:07

Пока что выводы такие:
1. Наконец-то признались, что рибоза+азотистое основание не дает нуклеозида. Никак. Признались, потому что нашли способ обойти.
2. Нельзя сказать, что исходные ингредиенты - цианамид, цианоацетилен, гликольалдегид, глицеральдегид и фосфат - это соединения, которые кишмя кишат в океанах или атмосфере. Тем не менее, они используются в концентрациях 1-49 ммоль/л, а фосфат - 1 моль/л.
3. вопрос стереоизомеров не решен, насколько я понял, т.е. получается смесь стереоизомеров, рацемат, на след. стадии берется чистый нужный стереоизомер, без ненужного.
4. получается много ненужных нуклеотидов, ненужные убирается ультрафиолетом, поскольку цитозин и урацил - самые УФ-стабильные. При этом, еще недавно мне доказывали. что тот самый нужный УФ не добивает до поверхности Земли, даже в безкислородной атмосфере...
Аватар пользователя
р.Б.Константин
Супермодератор
 
Сообщений: 215
Зарегистрирован: 17 апр 2008, 23:26
Кредо: Creatio+Evolutio

Re: Абиотический синтез пиримидиновых нуклеотидов

Сообщение Лужехмур » 18 май 2009, 15:38

Урааа!!! Р.Б.Константин пришёл! :Yahoo!: :Bravo:

Ещё два вопроса:

1. Марков на "Элементах" пишет "Химики преодолели главное препятствие на пути к абиогенному синтезу РНК". Насколько это препятствие главное?
2. Я так понимаю, сейчас с новой силой начнутся споры о возможности абиогенеза?
Лужехмур
Форумчанин
 
Сообщений: 65
Зарегистрирован: 31 янв 2009, 17:57

Re: Абиотический синтез пиримидиновых нуклеотидов

Сообщение р.Б.Константин » 18 май 2009, 19:44

Лужехмур писал(а):Урааа!!! Р.Б.Константин пришёл! :Yahoo!: :Bravo:

Ещё два вопроса:

1. Марков на "Элементах" пишет "Химики преодолели главное препятствие на пути к абиогенному синтезу РНК". Насколько это препятствие главное?
2. Я так понимаю, сейчас с новой силой начнутся споры о возможности абиогенеза?


1. - Смотря что подразумевать под "абиогенным синтезом". циклические нуклеотиды, которые образуются данных опытах (cUMP, cCMP) могут "спонтанно" образовывать короткие РНК - 5-6-7 олигонуклеотиды. Пуриновые нуклеотиды (AMP, GMP) имеют азотистые основания другого типа, и эти реакции к ним неприменимы.

Вот только что мне не нравится в таких статьях и опытах, что ничего не говорится о трудностях. Например, прочитав статью не поймешь, как там обстоят дела со стереоизомерами (D-рибоза). В отдельном приложении к статье расписывается, что нуклеотиды синтезировали не "подряд", а в виде отдельных "кусочных аппроксимаций", когда продукты реакции берутся в очищенном виде, один стереоизомер из двух, и "спонтанно синтезируют" дальше.

Но в любом случае, если реакция идет на половину, то дальше уже "семечки".

2. Может быть и начнутся, но только в pop-science :). Типа того, как сейчас пишут чуть ли не что ученые синтезировали жизнь, на худой конец - ДНК.

С учетом того, что Миллер получил Нобелевскую премию в 50-х, а статью о нестабильности рибозы и азотистых оснований опубликовал в 90-х нужно ждать сорок лет, пока кто-нибудь не напишет что-нибудь типа того, что на самом деле продукты реакции нестабильны и плохо реагируют :).
Аватар пользователя
р.Б.Константин
Супермодератор
 
Сообщений: 215
Зарегистрирован: 17 апр 2008, 23:26
Кредо: Creatio+Evolutio

Re: Абиотический синтез пиримидиновых нуклеотидов

Сообщение Андрей М. » 24 июн 2009, 00:48

Подождите, потом выяснится, что что-то плохо помыли или чхнули, как случилось с "разгадкой" ДНК человека.
Андрей М.
Форумчанин
 
Сообщений: 49
Зарегистрирован: 22 июн 2009, 01:06

Re: Абиотический синтез пиримидиновых нуклеотидов

Сообщение р.Б.Константин » 27 июн 2009, 13:12

Анабаптист писал(а):Подождите, потом выяснится, что что-то плохо помыли или чхнули, как случилось с "разгадкой" ДНК человека.
--А что случилось с разгадкой ДНК человека?
Аватар пользователя
р.Б.Константин
Супермодератор
 
Сообщений: 215
Зарегистрирован: 17 апр 2008, 23:26
Кредо: Creatio+Evolutio

Re: Абиотический синтез пиримидиновых нуклеотидов

Сообщение Андрей М. » 02 июл 2009, 18:18

р.Б.Константин писал(а):-А что случилось с разгадкой ДНК человека?

Лет 8-9 назад мир взорвала новость - учёные расшифровали язык, по которому Господь Бог сотворил человека (имелась ввиду ДНК человека). Через два дня выяснилось, что не до конца расшифровали, а ещё через несколько дней выяснилось, что далеко не до конца.
Андрей М.
Форумчанин
 
Сообщений: 49
Зарегистрирован: 22 июн 2009, 01:06

Re: Абиотический синтез пиримидиновых нуклеотидов

Сообщение р.Б.Константин » 20 янв 2018, 15:21

Андрей М. писал(а):
р.Б.Константин писал(а):-А что случилось с разгадкой ДНК человека?

Лет 8-9 назад мир взорвала новость - учёные расшифровали язык, по которому Господь Бог сотворил человека (имелась ввиду ДНК человека). Через два дня выяснилось, что не до конца расшифровали, а ещё через несколько дней выяснилось, что далеко не до конца.
--Мне кажется, вы что-то напутали...


Последний раз поднималось р.Б.Константин 20 янв 2018, 15:21.
Аватар пользователя
р.Б.Константин
Супермодератор
 
Сообщений: 215
Зарегистрирован: 17 апр 2008, 23:26
Кредо: Creatio+Evolutio


Вернуться в Абиогенез

Кто сейчас на форуме

Сейчас этот форум просматривают: нет зарегистрированных пользователей и гости: 1

Golden Time-Золотое Время. История, религия, наука